南京鼓楼医院（南京大学医学院附属鼓楼医院）输血科成立于2006年，经过近20年的努力，目前已发展为集医疗、教学、科研为一体的平台科室，南京市医学重点专科，全国血液安全监测单位，荣获江苏省输血协会“先进临床输血科”称号。
输血科于2017年通过中国合格评定国家认可委员会（CNAS）ISO15189医学实验室认可，牢记“厚德、进取、求实、卓越”的鼓医精神，秉承“公正保密、及时准确、持续改进、安全有效”的质量方针，坚持以患者为中心，不断提升临床技术服务能力，更好地为临床科室和患者服务，助力医院高质量发展。
科室主要职责是提供临床输血技术服务和保障临床输血安全有效，同时参与医院输血管理、合理用血监控、输血新技术推广和临床输血治疗等工作。科室拥有4名输血医师，技师18人；高级职称2人，中级职称10人；博士1名，硕士8名。开设输血医学门诊及互联网医院咨询门诊，参与临床MDT等。
科室承担本科生实习带教、研究生培养、并为进修生开设多门个性化的小班培训课程。主持多项国家、省、市级课题等，荣获江苏省医学新技术引进二等奖，江苏医学科技奖三等奖，南京市新技术二等奖。