鼓楼医院生殖医学中心，创建于2001年，是妇产科的特色专科之一，是原国家卫生部首批批准开展人类辅助生殖技术的5家单位之一，是国家卫生计生委批准开展高通量基因测序植入前胚胎遗传学诊断（PGD）临床应用试点工作13家单位之一；同时也是江苏省妇幼保健重点专科和江苏省“十二五科教兴卫工程”生殖医学创新团队。常规开展宫腔内人工授精技术、体外受精-胚胎移植术、卵细胞浆内单精子注射技术、配子与胚胎冻融技术、胚胎种植前遗传学诊断/筛查技术、未成熟卵体外成熟培养技术等一系列辅助生殖技术。南京鼓楼医院生殖医学科位列最新复旦版中国医院排行榜生殖医学专科声誉排行榜第6名（2020年度）。

本中心年接诊来自全国各地及海外不孕症患者20余万人次，体外受精-胚胎移植年取卵周期数超7500周期，鲜胚移植临床妊娠率持续保持65%以上，分娩率达55%，保持国际及国内领先水平。除辅助生殖技术外，在多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症、子宫腺肌症、卵巢早衰、反复种植失败等疑难杂症方面具有特色诊治经验，达国内先进水平。

目前中心共两个院区，工作面积达20000平方米。共有员工125名，其中高级职称人员19名，博士生导师4名，硕士生导师7名。经过20年不断开拓创新和蓬勃发展，本中心以临床治疗为主导，基础研究临床转化相结合，形成了一支以中青年为主，兼具医、教、研能力的人才梯队。在国内提出体外受精同步化促排卵临床方案，率先开展早期补救性单精子卵胞质内注射技术，在全国推广应用后，对全国试管婴儿成功率的普遍提升做出了重要贡献。开展时差成像技术应用于胚胎评估，在保证妊娠结局的同时有效降低多胎妊娠率。本中心在植入前遗传学诊断系列技术及人类成体干细胞临床应用研究以及子宫内膜容受性基础与临床转化研究等均获重要进展。生殖医学中心获得科技部 “973” 计划子课题（1项）、中科院战略性先导科技专项子课题（2项）、国家重点研发专项子课题（3项），国家自然科学基金（37项，其中一项为重点项目），以及多项省部级基金项目。近年在国内外专业期刊发表论著216 篇，其中SCI 收录106篇。获得江苏省科学技术一等奖1项，江苏省医学科技奖二等奖1项，江苏省科技进步奖三等2项，江苏省医学新技术引进一等奖2项、二等奖6项。